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康健医疗大数据实践中的重难点 | 聚焦前沿‘米乐m6’

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康健医疗大数据实践中的重难点 | 聚焦前沿‘米乐m6’

2022-08-01  点击量:

本文摘要:导读:康健医疗大数据是国家重要的基础性战略资源。

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导读:康健医疗大数据是国家重要的基础性战略资源。康健医疗大数据应用生长将带来康健医疗模式的深刻变化,提升康健医疗服务效率和质量,有利于培育新的业态和经济增长点。当前我国以致全球许多国家都在开展康健医疗大数据的探索与实践,本文围绕康健医疗大数据的工程学实践探讨其中各环节的注意事项。

十多年来,“大数据(Big data)”一词一直被用来形貌可用信息的数量、种类和速度的快速增长,这些信息不仅存在于医学研究领域,而且险些存在于我们生活的各个方面。我们现在有能力快速发生、存储和分析数据,而仅仅在几年前,这些数据还需要许多年的时间来整理。然而,“大数据”这个术语的寄义已经扩展了,现在不仅指海量数据,还指我们分析息争释这些数据的能力不停增强。使用新工具从大量数据中提取有可能推动临床实践的信息,从个性化治疗和智能药物设计到人群筛查和电子康健记载挖掘。

只管新技术预示着庞大的进步,但重大的挑战依然存在。本文,小编将先容随着我们处置惩罚大型数据能力日益增强的同时给生物医学研究和精准医疗带来的机缘和挑战。

技术的进步已经而且将继续缔造出越来越多的能力来对单个样品举行多重丈量。这可能会导致同时举行数百、数千甚至数百万次丈量,通常会联合使用多种技术来同时丈量DNA、RNA、卵白质、代谢功效以及临床特征。

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如果我们的目的是相识疾病的庞大性,那么我们必须需要明白现在可以快速发生的庞大数据量。大数据方法的生长极大地增强了我们对生物医学的明白能力。精准医疗可以简要地界说为一种在正确的时间为正确的患者提供正确治疗的方法。

随着大数据方法越来越多地应用,有望资助我们实现这一理想目的。01 医疗大数据的使用障碍医学上的大数据观点并不难掌握:使用大量医学信息来寻找趋势或关联,而在较小的数据集中则无法发现这些趋势或关联。

那么,为什么没有更广泛地使用大数据呢?来自患者小我私家数据的大量医学信息是否有可能被用来识别新的风险或治疗选择,然后可以在小我私家层面应用这些新的风险或治疗选择以改善效果?在大多数情况下,医疗系统的数据存储比力庞大,代表私人深度信息的医疗记载受到专门掩护,不能公然获取。广泛地说,主要的障碍存在于获取数据方面。为了革新将现有数据转换为新的医疗保健解决方案,需要解决许多方面的问题。

这些包罗(但不限于)异构数据集的收集和尺度化、数据的治理、使用非识别数据的事先知情同意,以及能够将这些数据提供应医疗保健研究人员以供进一步使用。02 数据价值与权益由于任何类型的患者数据都生存在医疗机构中,因此这些数据似乎属于该机构。可是,这些机构仅充当此数据的保管人。

数据是患者的产业,在临床领域之外会见和使用该数据需要患者的同意。这就导致了难以对已生存的大量临床数据的快速使用。

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只管回首性假设驱动的研究可以像处置惩罚任何研究一样对匿名数据举行,可是一旦研究竣事,数据就应该被销毁。对于使用成千上万个数据点的大数据技术而言,在项目竣事时销毁这些数据的前景与医学知识的生长南辕北辙。

因此,患者对存储和使用其数据的许可同意能发生很是大的能量,允许大数据集的积累,然后允许对这些数据应用假设驱动的研究问题。虽然不使用海量的回首性数据会让人感受浪费,但在医疗领域,新数据积累的速度很是快,因此获得的公认数据要有价值得多。

电子康健记载(EHR)本质上是一种庞大的资源,因为蓬勃国家的大多数患者都在这种情况下接受治疗。每小我私家纵向收集的信息量惊人,包罗实验室测试效果、诊断、文本和成像。数十年来,已经系统地收集了大量信息,而成本实际上为零。

只管EHR通常用于临床照顾护士、计费和审计,但它越来越多地被用于大规模取证。基于人群的研究往往是针对疾病的,可是EHR在很大水平上与疾病无关。因此,EHR提供了研究险些所有疾病以及风险因素(如遗传变异)的多效性影响的时机(图1)。

由于EHR最初并不是为生成证据而设计的,因此使用这些数据在数据收集,尺度化和治理方面具有一定挑战。只管存在研究一系列表型的时机,但EHR中包罗的数据通常不像基于行列研究中所收集的那样严格或完整。然而,这些EHR为涉及大数据的问题提供了潜在的解决方案,包罗数据的可靠性和尺度化以及EHR表型的准确性。图1|使用电子康健记载举行研究和质量革新03 数据共享原则通用数据掩护条例(General Data Protection Regulation),简称GDPR,是欧盟秉着“主顾优先”的态度出台的小我私家数据掩护新规。

该划定于2016年4月14日出台,定于2018年5月25日正式投入实施,面向所有收集、处置惩罚、储存、治理欧盟公民小我私家数据的企业,限制了这些企业收集与处置惩罚用户小我私家信息的权限,旨在将小我私家信息的最终控制权交还给用户本人(图1)。条例规模主要包罗:(1)重新界说“小我私家信息”;(2)适用规模增大;(3)优化数据处置惩罚体系;(4)责任共担;(5)取得用户批准;(6)掩护消费者权益;(7)对于儿童的特殊掩护;(8)发现违规后实时通知羁系人员;(9)处罚力度增强。详见:https://gdpr-info.eu/。

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图2|通用数据掩护法例(GDPR)04 数据收集尺度为了举行可靠的验证,必须确保在训练行列中举行的丈量与测试集中的丈量具有可比性。这听起来很简朴,但事实并非如此。在已往的二十年中,已经建设了确保从血液和其他新鲜组织中提取的基因组质料(例如DNA)尺度化的方法,包罗自动化方法。

可是,其他样本(例如来自石蜡包埋的组织的DNA,RNA,卵白质)对组织。


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